Sede Principal: Centro de Referencia Nacional de Influenza y otros Virus Respiratorios – Guayaquil.

Sedes Zonales: Laboratorios zonales de Influenza y otros Virus Respiratorios sede Quito y Cuenca.

Se incluye actualmente la oficina técnica: Laboratorio zonal de Influenza y otros Virus Respiratorios oficina técnica Tena

El CRN de Influenza y otros Virus Respiratorios (CRNIOVR), es el responsable de coordinar a nivel nacional y brindar la capacidad resolutiva en la vigilancia de laboratorio y la vigilancia genómica de las enfermedades virales respiratorias. Es el punto focal de país de las redes de vigilancia internacional en el área de su competencia, lo que permite homologar y vincular la vigilancia nacional al contexto internacional y dar cumplimiento a los compromisos en el marco del Reglamento Sanitario Internacional (RSI-2005).

Entre los principales eventos a vigilar están las infecciones respiratorias agudas graves (IRAG), así como también, se contribuye con la identificación de eventos que requiere la autoridad sanitaria calificados como síndromes compatibles con enfermedades transmisibles de alto potencial epidémico/pandémico en la que incluyen además las enfermedades respiratorias inusitadas debida a virus de la influenza de origen aviar y de otro origen animal como el síndrome respiratorio agudo severo – SARS, MERS, entre otros.

Este Centro tiene el propósito de estar alertas ante la posible introducción de nuevos subtipos de influenza con potencial pandémico y/o epidémico, los mismos que tendrían un alto impacto en la salud pública de los Ecuatorianos, mediante la aplicación de técnicas especializadas, equipamiento con tecnología de punta, estándares de calidad y personal calificado para la oportuna caracterización de los Virus Respiratorios y su respectivo análisis que será de gran utilidad en la toma de decisiones por parte de las autoridades de Salud.

El CRNIOVR hasta la presente fecha ha enfrentado dos pandemias del siglo XXI, la primera fue la detección por primera vez de un nuevo subtipo de Influenza AH1N1pdm en el año 2009 y la segunda, la detección por primera vez de un nuevo virus el SARS-CoV-2.

Con la llegada de la pandemia de la COVID-19 el CRN de Influenza y Otros Virus Respiratorios como parte de su mejora continua, implementa en mayo del 2021 la vigilancia genómica sistemática y rutinaria de SARS-CoV-2, misma que se sustenta en la siguiente base legal vigente:

• Lineamientos de la vigilancia integrada del SARS-CoV-2 en la cual indica: “Se deberá coordinar con el Centro de Referencia Nacional de Influenza y otros Virus Respiratorios del INSPI…”
• Lineamientos operativos abordaje para brotes de Influenza estacional, mismo que indica: “El Centro de Referencia Nacional de Influenza y otros Virus Respiratorios del INSPI es el encargado de realizar y consolidar la secuenciación genómica del SARS-CoV-2 Influenza y otros Virus Respiratorios a nivel nacional y reportar la circulación de virus respiratorios”… OPS/OMS.
• Influenza and SARS-CoV-2 integrated surveillance laboratory testing algorithm Vigilancia integrada de Influenza y SARS-CoV-2 emitido por la OMS, en la cual se estable coordinar con el Centro Nacional de Influenza.

El Laboratorio de Influenza tiene la siguiente presencia en territorio:

Sede Principal: Centro de Referencia Nacional de Influenza y otros Virus Respiratorios – Guayaquil.

Sedes Zonales: Laboratorios zonales de Influenza y otros Virus Respiratorios sede Quito y Cuenca.

Se incluye actualmente la oficina técnica: Laboratorio zonal de Influenza y otros Virus Respiratorios oficina técnica Tena

Misión:

Ser la referencia nacional e internacional en la vigilancia por laboratorio y genómica de virus respiratorios para la región de las Américas en la preparación y respuesta en eventos emergentes, garantizando un servicio de calidad mediante entrega de resultados confiables u oportunos, la transferencia tecnológica y científica en el área de la salud y la generación de propuestas de investigación en beneficio de la salud pública para la consecución del buen vivir.

Visión

Es el laboratorio de Referencia Nacional de Influenza y Otros Virus Respiratorios que apoya la vigilancia epidemiológica y genómica de virus respiratorios con técnicas especializadas para responder ante emergencias de salud pública, bajo parámetros internacionales establecidos, con la finalidad de apoyar en la implementación de las políticas y estrategias de salud pública emitidas por el Ministerio de Salud Pública.

• Identificación del tipo del virus de Influenza A en casos con infecciones respiratorias agudas graves mediante la técnica qRT-PCR
• Identificación del tipo del virus de Influenza B en casos con infecciones respiratorias agudas graves mediante la técnica qRT-PCR
• Identificación del subtipo de virus de Influenza A/H1N1pdm2009 en casos con infecciones respiratorias agudas graves mediante la técnica qRT-PCR
• Identificación del subtipo de virus de Influenza SW en casos con  infecciones respiratorias agudas graves mediante la técnica qRT-PCR
• Identificación del subtipo de virus de Influenza A/H3N2 en casos con  infecciones respiratorias agudas graves mediante la técnica qRT-PCR
• Identificación del subtipo de virus de Influenza H5a casos con  infecciones respiratorias agudas graves  mediante la técnica qRT-PCR
• Identificación del subtipo de virus de Influenza H5b en casos con infecciones respiratorias agudas graves mediante la técnica qRT-PCR
• Identificación del subtipo de virus de Influenza H7 en casos con  infecciones respiratorias agudas graves mediante la técnica qRT-PCR
• Identificación de otros virus respiratorios (Influenza A, Influenza B, Virus Sincitial Respiratorio, Parainfluenza I,Parainfluenza II, Parainfluenza III, Adenovirus y Metapneumovirus) en casos con  infecciones respiratorias agudas graves  mediante Inmunofluorescencia directa de antígenos virales
• Identificación de otros virus respiratorios (Virus Sincitial Respiratorio) en casos con infecciones respiratorias agudas graves mediante Inmunofluorescencia directa del antígeno viral con anticuerpo monoclonal
• Identificación de otros virus respiratorios (Adenovirus) en casos con infecciones respiratorias agudas graves mediante Inmunofluorescencia directa del antígeno viral con anticuerpo monoclonal
• Identificación de otros virus respiratorios (Parainfluenza I) en casos con infecciones respiratorias agudas graves mediante Inmunofluorescencia directa del antígeno viral con anticuerpo monoclonal
• Identificación de otros virus respiratorios (Parainfluenza II) en casos con infecciones respiratorias agudas grave mediante Inmunofluorescencia directa del antígeno Viral con Anticuerpo Monoclonales
• Identificación de otros virus respiratorios (Parainfluenza III) en casos con infecciones respiratorias agudas graves mediante Inmunofluorescencia directa del antígeno viral con anticuerpo monoclonal
• Identificación de otros virus respiratorios (Metapneumovirus) en casos con infecciones respiratorias agudas graves mediante inmunofluorescencia directa del antígeno viral con anticuerpo monoclonal
• Identificación del tipo del virus de Influenza A en casos Inusitados mediante qRT-PCR
• Identificación del tipo del virus de Influenza B en casos Inusitados mediante RT-qPCR
• Identificación del subtipo de virus de Influenza A/H1N1pdm2009 en casos inusitados mediante RT-qPCR
• Identificación del subtipo de virus de Influenza SW en Casos Inusitados mediante RT-qPCR
• Identificación del subtipo de virus de Influenza A/H3N2 en casos Inusitados
• Identificación del subtipo de virus de Influenza H5a en casos Inusitados
• Identificación del subtipo de virus de Influenza H5b en casos inusitados mediante RT-qPCR
• Identificación del subtipo de virus de Influenza H7 en casos inusitados mediante RT-qPCR
• Identificación de otros virus respiratorios (Influenza A, Influenza B, Virus Sincitial Respiratorio, Parainfluenza I,Parainfluenza II, Parainfluenza III, Adenovirus y Metapneumovirus) en casos con infecciones respiratorias agudas graves en casos inusitados mediante inmunofluorescencia directa de antígenos Virales
• Identificación de otros virus respiratorios (Virus Sincitial Respiratorio) en casos inusitados mediante inmunofluorescencia directa del antígeno viral con anticuerpo monoclonal.
• Identificación de otros virus respiratorios (Adenovirus) en casos inusitados mediante Inmunofluorescencia directa del antígeno viral con anticuerpo monoclonal
• Identificación de otros virus respiratorios (Parainfluenza I) en casos inusitados mediante inmunofluorescencia directa del antígeno viral con anticuerpo monoclonal
• Identificación de otros virus respiratorios (Parainfluenza II) en casos Inusitados mediante inmunofluorescencia directa del antígeno viral con anticuerpo monoclonal
• Identificación de otros virus respiratorios (Parainfluenza III) en casos inusitados mediante inmunofluorescencia directa del antígeno viral con anticuerpo monoclonal
• Identificación de otros virus respiratorios (Metapneumovirus) en casos Inusitados mediante Inmunofluorescencia directa del antígeno viral con anticuerpo monoclonal
• Identificación de Panel de 40 Virus Respiratorios mediante secuenciación
• Identificación de genotipos del virus de Influenza B / Yamagata mediante RT-qPCR
• Identificación de genotipos del virus de Influenza B / Victoria mediante RT-qPCR
• Vigilancia Universal de SARS CoV2 mediante la técnica de RT-qPCR
• Genotificación de Variantes de SARS CoV2 mediante secuenciación.

Sede Principal

• Maritza Olmedo Herrera
  Tnlga. en Laboratorio Clínico.
  Lcda. en Laboratorio Clínico.
• Denisses Portugal Burgos
  Tnlga. en Laboratorio Clínico.
  Lcda. en Laboratorio Clínico.
• Jimmy Garcés Sánchez
  Médico Veterinario Y Zootecnista.

Coordinación CZ9 – Quito

• Ruth Gómez Carrera
  Ing. en Biotecnología.
• Diana Herrera Villarroel
  Ing. en Biotecnología.
  MSc. en Biotecnología.
• Paul Herrera
  Ing. en Biotecnología.
• Cynthia Gordon Villegas
  Lcda. en Biología.
• Paul Herrera
  Ing. en Biotecnología.

Coordinación CZ6 – Cuenca

• María Pardo Vicuña
  Tnlga. Laboratorista Clínico.
  Tnlga. Médica en Laboratorio Cliníco.
  Químico Farmacéutica.
  MSc. en Ciencias y Tecnologías Cosméticas.
• Paola Pizarro Rosas
  Bioquímico Farmacéutica.
• María Quezada Zambrano
  Bioquímico Farmacéutica.

• Red Global de Virus Respiratorios OMS
• El CRN del INSPI es reconocido a nivel internacional por la comunidad científica y forma parte de la Red Global de Vigilancia de la OMS/OPS desde el 2006 oficialmente.
• Red Regional de Vigilancia Genómica ORAS-CONHU

Control de calidad supra nacional:

Desde el 2007 hasta la presente el CRN de Influenza y Otros Virus Respiratorios ha obtenido la calificación de 100% de concordancia en los paneles enviados por OMS

Control de calidad interno:

Desde el año 2011 como parte de la implantación de la vigilancia centinela de Virus Respiratorios, se realiza de manera anual el control de calidad a la rede de laboratorios zonales de Influenza y Otros Virus Respiratorios del INSPI.

Normas ISO

Implementación de las Norma ISO 15189 desde el 2017; actualmente, debido a las remodelaciones en cuanto a infraestructura del CRN con la finalidad de potenciar de un área de contención nivel 3 de bioseguridad, estamos retomando las normas y acreditación.

El CRN se encuentra participando los siguientes proyectos:

Proyectos realizados:

• Evaluación de la efectividad de la vacuna contra la COVID-19 en América Latina y el Caribe” (Protocolo Ministerio de Salud Pública del Ecuador). REVELAC-I
• Fortalecimiento Regional de Vigilancia Genética de Influenza en colaboración y financiamiento de la OPS/OMS.
• Virus Respiratorios asociados con enfermedades respiratorios, análisis de muestras nasofaríngeas tomadas de niños sintomáticos en Quininde ente los años 2011 – 2014 (CDC de Atlanta USA – INSPI – UIDE)
• Implementación de genética inversa para la investigación epidemiológica molecular de Influenza A y desarrollo de virus recombinantes como base para generar vacunas (código de proyecto 3202 – 2420)

Proyectos en ejecución:

• Coinfección tos ferina y COVID-19 en Ecuador (en ejecución con OPS/MSP, código de registro PFE-IDi-01-2023)
• Fortalecimiento de la toma de decisiones en el control de la pandemia de COVID-19 mediante la vigilancia genómica en los países de Bolivia, Colombia, Ecuador y Perú (en ejecución con el ORA-CONHU/INSPI/BID

Productos obtenidos

• I Taller de Intercambio para el diagnóstico de estado inicial de procedimientos de vigilancia genómica de los países de Bolivia, Colombia, Ecuador y Perú, Lima – Perú, del 25 al 27de enero del 2023.
• II Taller de Intercambio de Protocolos de Vigilancia Genómica y Estrategias de Comunicación Efectiva de los países de Bolivia, Colombia, Ecuador y Perú Guayaquil – Ecuador, de 18 al 20 de septiembre 2023
• Observatorio de vigilancia Genómica de SARS-CoV-2
• Red Regional de Vigilancia Genómica
• Propuesta de implementación en los Institutos Nacionales de Salud (INS) de Bolivia, Colombia, Ecuador y Perú
• Revista informativa Estación Vigilancia Genómica
• Carta de agradecimiento por el apoyo y supervisión para la exitosa implementación de protocolos para los Work flows bioinformáticos en el INSPI a través del proyecto de Vigilancia Genómica de ORAS-CONHU.

Proyectos en elaboración:

• Propuesta de proyecto Carga de enfermedad por virus sincitial respiratorio en niños menores de 2 años hospitalizados en Ecuador, 2022-2023 (INSPI/OPS/MSP/CDC)
• Propuesta de proyecto Prevención /control de la influenza aviar altamente patógena (IAAP) de la Pandemic Fund (FAO)
• Evaluación de efectividad de vacunas contra la COVID-19 en niños, adolescentes y mujeres embarazadas
• Fortalecimiento de la vigilancia intersectorial de influenza aviar, multisectorial con el MSP/INSPI/MAATE

En el año 2005 ante la alerta de casos de Influenza aviar H5N1 que se presentaron en Hong Kong y otros países del continente asiática y acorde a lo establecido en el Reglamento Sanitario Internacional en la 58ava Asamblea de la OMS, con el Propósito de prevenir, proteger, controlar y proveer una respuesta de salud pública a la difusión internacional de enfermedades y recomienda a los países a mantener una vigilancia activa de enfermedades y eventos de salud pública.

También urge a fortalecer y responder rápidamente, ante eventos de dispersión internacional y contener cualquier amenaza para la salud pública y obliga a los Estados Miembros de la OMS a establecer mecanismos para proporcionar una identificación y caracterización confiable y oportuna de los agentes infecciosos y otros peligros que puedan causar emergencias de salud pública de interés nacional e internacional, incluyendo el envío de especímenes a los laboratorios apropiados si es necesario como sería la probable transmisión de un virus de la Influenza aviar con potencial pandémico.

A lo largo de la historia, los virus respiratorios han sido los principales responsables de algunas de las peores pandemias y emergencias sanitarias, entre los cuales se pueden mencionar: Pandemia de 1918-1920 (Gripe Española); Pandemia de 1957-1958 (Gripe Asiática); Pandemia de 1968-1969 (Gripe de Hong Kong); Pandemia de 2009 (Gripe A H1N1); Emergencia por Síndrome Respiratorio de Oriente Medio (MERS); Pandemia de COVID-19; Emergencia de la Influenza Aviar H5N1 que se encuentra evidenciando un alarmante proceso de adaptación en mamíferos que podría facilitar en cualquier momento un virus con potencial pandémico.

La rápida globalización y el aumento de los viajes internacionales han incrementado el riesgo de la aparición y propagación de nuevos virus respiratorios. Por lo tanto, es imperativo invertir en la capacidad de detección temprana, diagnóstico y respuesta ante estos eventos de manera oportuna.

Durante la pandemia del COVID-19 en el 2020, el INSPI solo contaba con una área de contención perteneciente al Centro de Referencia Nacional de Tuberculosis ubicado en las calle Julián Coronel 905 y Esmeraldas, sin embargo, considerando la magnitud de la pandemia y ante la amenaza de un posible incremento de la letalidad del virus de SARS-CoV-2, se vio la urgencia de potenciar y fortalecer el nivel de contención de bioseguridad del área de procesamiento de muestras del Centro de Referencia Nacional de Influenza y Otros Virus respiratorios de fácil y rápida propagación.

Por lo anteriormente expuesto, se solicitó fondos mediante un proyecto de cooperación internacional con la finalidad de actualizar el nivel de bioseguridad del Centro de Referencia Nacional de Influenza y otros Virus Respiratorios como una acción estratégica para el manejo de patógenos respiratorios con potencial pandémico – epidémico y a la vez cuente con la versatilidad para brindar contingencia en caso de presentarse una alerta epidemiológica de otros agentes patógenos virales emergentes que requerían ser manejados en un nivel de contención de bioseguridad 3, acorde a los criterios establecido en el RSI y en articulación con el MSP con el objetivo de fortalecer la capacidad de vigilancia por laboratorio durante brotes, permitiendo una respuesta más rápida y efectiva para el control y mitigación de incidentes con agentes infecciosos.

El Programa inició en Ecuador el 31 de marzo de 2022. A finales de agosto del mismo año GIZ concretó la contratación de un Consultor para el diseño del laboratorio en el edificio donde funciona el Centro de Referencia Nacional (CRN) de Influenza y Otros Virus Respiratorios.  

Entre agosto y diciembre de 2022 se escogió una de las dos áreas planteadas por el INSPI para la ubicación del BSL-3, la cual se encuentra dentro del laboratorio de Influenza y OVR. Los planos de diseño del BSL-3 fueron entregados al INSPI el 10 de marzo de 2023 y validados el 6 de abril. El inicio de intervención está planificado para el 1 de agosto de 2023.

Actualmente se estima que la obra será entregada a finales del mes de octubre del 2024.

• Incidence and seasonality of respiratory viruses among medically attended children with acute respiratory infections in an Ecuador birth cohort, 2011–2014 https://doi.org/10.1111/irv.12887
• Dispersion patterns of SARS-CoV-2 variants Gamma, Lambda and Mu in Latin America and the Caribbean https://doi.org/10.1038/s41467-024-46143-9
• Spatial, temporal and evolutionary insight into seasonal epidemic Influenza A virus strains near the equatorial line: The case of Ecuador https://doi.org/10.1016/j.virusres.2023.199051
• First case of human infection with highly pathogenic H5 avian Influenza A virus in South America: A new zoonotic pandemic threat for 2023? https://doi.org/10.1093/jtm/taad032
• The quality of commercial SARS-CoV-2 nucleic acid tests in Ecuador: lessons from COVID-19 pandemic for advancing social equity through microbiology. DOI 10.3389/fcimb.2023.1179786
• Virological evidence of the impact of non-pharmaceutical interventions against COVID-19 in a resource-limited setting. doi: 10.1080/22221751.2023.2259001
• First Report of SARS-CoV-2 Lineage B.1.1.7 (Alpha Variant) in Ecuador, January 2021. doi: 10.2147/IDR.S319439
• First Operational plan for the national routine and systematic genomic surveillance of SARS-CoV-2 in Ecuador. DOI: https://doi.org/10.31790/inspilip.v5i3.232
• Implementation of a COVID-19 Genomic Surveillance Regional Network for Latin America and Caribbean región. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0252526
• High SARS-CoV-2 viral load in travellers arriving in Spain with a negative COVID-19 test prior to departure: Ecuador as a model for COVID-19 testing quality in Latin America. https://doi.org/10.1093/jtm/taac120
• Burden of influenza-associated respiratory hospitalizations in the Americas, 2010–2015. doi: 10.1371/journal.pone.0221479
• Temporal Patterns of Influenza A and B in Tropical and Temperate Countries: What Are The Lessons for Influenza Vaccination? doi: 10.1371/journal.pone.0152310
• Patterns of influenza B circulation in Latin America and the Caribbean, 2010–2017. doi: 1371/journal.pone.0219595
• Change in Age profile of Respiratory Syncytial Virus disease over the course of annual epidemics: a multi-national study. https://doi.org/10.1016/j.jinf.2024.106154
• The epidemiology and severity of respiratory viral infections in a tropical country: Ecuador, 2009–2016. https://doi.org/10.1016/j.jiph.2018.12.003
• The epidemiological signature of influenza B virus and its B/Victoria and B/Yamagata lineages in the 21st century. doi: 1371/journal.pone.0222381
• Omicron Sub-Lineages (BA.1.1.529 + BA.*) Current Status in Ecuador. https://doi.org/10.3390/v14061177
• Phylogenetic analysis reveals that the H5N1 avian influenza A outbreak in poultry in Ecuador in November 2022 is associated to the highly pathogenic clade 2.3.4.4b. https://doi.org/10.1016/j.ijid.2023.04.403
• Estimates of global seasonal influenza-associated respiratory mortality: a modelling study. https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(17)33293-2/abstract?cc=y%3D
• Distribution of influenza virus types by age using case-based global surveillance data from twenty-nine countries, 1999-2014. https://doi.org/10.1186/s12879-018-3181-y
• Strengthening the influenza vaccine virus selection and development process: Report of the 3 WHO information Consultation for improving Influenza Vaccine Virus Selection held at WHO headquarters, Geneva, Switzarland 1 -3 Abril 2014. http://dx.doi.org/10.1016/j.vaccine.2015.06.090
• Timing of Influenza Epidemics and Vaccines In the American Tropics, 2002-2008, 2011 – 2014. DOI: 10.1111/irv.12371
• Characteristics of seasonal influenza A and B in Latin America: Influenza surveillance data from ten countries. DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0174592
• Vigilancia Genómica: Relación Evolutiva entre los Virus de Influenza H3N2, Ecuador. DOI 10.31790/inspilip.v4i1.111
• Effectiveness of COVID-19 vaccines in Ecuador: A test-negative design. DOI: https://doi.org/10.1016/j.jvacx.2023.100404
• Effectiveness of COVID-19 vaccines against hospitalisation in Latin America during three pandemic waves, 2021–2022: a test-negative case-control design. DOI: https://doi.org/10.1016/j.lana.2023.100626
• Evolutionary history of human infections with highly pathogenic H5 avian influenza A virus: a new front-line global health threat established in South America. DOI: https://doi.org/10.1093/jtm/taad130
• Vigilancia genómica: Subtipo de Influenza predominante, durante la epidemia estacional en Ecuador, 2018. DOI: 10.31790/inspilip.v4i1.112
• Distribución de Influenza B según linajes, Ecuador 2013 – 2016. DOI: 10.31790/inspilip.v4i4.110.g186
• Brief summary of the Influenza virological activity in Ecuador Reported by National Influenza Centre of Ecuador from INSPI. DOI:10.31790/inspilip.v4i5
• Analytical and Clinical Evaluation of Two RT-qPCR SARS-CoV-2 Diagnostic Tests with Emergency Use Authorization in Ecuador. doi:10.4269/ajtmh.20-1439
• The global epidemiology of RSV in community and hospitalized care: findings from 15 countries. doi: 10.1093/ofid/ofab159.
• Genomic epidemiology of SARS-CoV-2 transmission lineages in Ecuador. https://doi.org/10.1093/ve/veab051
• Estimated impact of maternal vaccination on global paediatric influenza-related in-hospital mortality: A retrospective case series. doi: 10.1016/j.eclinm.2021.100945.
• Analytical and clinical evaluation of a heat shock SARS-CoV-2 diagnosis method without RNA extraction for N and E genes RT-qPCR. doi: 10.1016/j.ijid.2021.06.038.
• COVID-19 laboratory preparedness and response in the Americas Region: Lessons learned. doi: 10.1371/journal.pone.0253334.
• Defining the seasonality of respiratory syncytial virus around the world: National and subnational surveillance data from 12 countries. doi: 10.1111/irv.12885.
• Highly pathogenic avian influenza A (H5N1) virus outbreak in Ecuador in 2022–2024.

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